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A
Alelo normal - Wild type alelle
El asociado al fenotipo normal, el más común en la población. Opuesto a alelo mutante. También llamado “alelo salvaje” o alelo silvestre”.
Autosómico recesivo - Autosomal recessive
Término que se utiliza para describir un rasgo o patología que requiere la presencia de las dos copias de un determinado alelo para que se exprese el fenotipo. Se refiere específicamente a los genes de uno de los 22 pares de autosomas.
Árbol genealógico que representa el patrón de herencia autosómica recesiva.

Probabilidad de que una mutación de un gen autosómico recesivo sea transmitida a los descendientes.

B
C
ClinVar -
Repositorio público de variantes genéticas relacionadas con fenotipos concretos que tiene como objetivo la interpretación de su significado clínico. Las clasificaciones incluidas en ClinVar presentan varios niveles de confianza representados por estrellas.

Correlación genotipo - fenotipo - Genotype - Phenotype correlation
Asociación entre determinada mutación o mutaciones (genotipo) y el fenotipo resultante.
Las posibles conclusiones sobre las correlaciones genotipo-fenotipo son las siguientes:
La estrecha correlación entre el genotipo y el fenotipo permite predecir el fenotipo de forma fiable, basándose en el genotipo.
La severidad y las manifestaciones clínicas específicas del fenotipo no se pueden predecir con seguridad debido a la amplia variabilidad de presentaciones fenotípicas entre los individuos que tienen el mismo genotipo.
No se han realizado estudios de correlación genotipo-fenotipo o bien éstos no son viables en la práctica debido al elevado número de mutaciones diferentes posibles.
A la inversa, la pregunta para la correlación fenotipo-genotipo es la siguiente: dado un fenotipo determinado ¿cuál es el genotipo más probable? En este caso, la evaluación del fenotipo sirve de orientación al médico/laboratorio respecto a las técnicas más apropiadas para la detección de mutaciones.
Ejemplo: Síndrome de deleción 22q11.2
Manifestaciones clínicas: Defectos cardíacos (en particular conotruncales), ausencia o función anormal del timo y/o las glándulas paratiroideas, paladar fisurado, rasgos faciales característicos, trastornos del habla y retraso del desarrollo.
Correlación genotipo-fenotipo: BAJA Un feto en el que se ha identificado la deleción 22q11.2 podría presentar todas las manifestaciones clínicas asociadas, sólo algunas de ellas o sólo trastornos del habla. No se puede predecir el fenotipo basándose en el genotipo.
Correlación fenotipo-genotipo: ALTA Niño nacido con defecto cardíaco conotruncal y ausencia de timo. La probabilidad de detectar una deleción en 22q11.2 es aproximadamente del 95%. El genotipo se puede predecir con seguridad basándose en el fenotipo.
D
Disomía uniparental - Uniparental disomy (sinónimo: UPD)
Situación en la que un par de cromosomas homólogos o algún segmento de un par de cromosomas homólogos son heredados de sólo uno de los progenitores. La disomía uniparental puede dar lugar a un fenotipo anormal en algunos casos. También se ha descrito disomía uniparental somática que afecta sólo a las células que componen un determinado tejido. En estos casos el origen de la disomía no es la herencia directa sino un proceso anómalo de replicación del ADN.

La disomía uniparental da lugar a un fenotipo anormal cuando los cromosomas implicados llevan impronta, por lo que los genes de estos cromosomas sólo tienen un alelo activo (es decir, sólo el alelo materno o paterno del par es activo).
Síndromes asociados con disomía uniparental (UPD)
Síndrome de Prader-Willi (UPD15 materno)
Síndrome de Angelman (UPD15 paterno)
Diabetes mellitus neonatal transitoria (UPD6 paterno)
Síndrome de Russell-Silver (UPD7 materno)
Síndrome de Beckwith-Wiedeman (UPD11 materno)
Síndrome de MUPD14 (UPD14 materno)
Dominante ligado al cromosoma X - X-linked dominant
Describe un rasgo o trastorno de manifestación dominante causado por una [GLOSARIO]mutación[FIN_GLOSARIO] en un gen del cromosoma X. El fenotipo está expresado en mujeres heterocigóticas, así como en varones hemicigóticos (que sólo tienen un cromosoma X); los varones afectados suelen presentar un fenotipo más severo que las mujeres afectadas.

Probabilidad de transmisión de una mutación de un gen dominante ligado al cromosoma X.

E
Eficacia biológica - Biological fitness
Eficacia es la representación cuantitativa de la selección natural y sexual dentro de la biología evolutiva. Se puede definir ya sea con respecto a un genotipo o a un fenotipo en un ambiente dado. En cualquier caso, describe el éxito reproductivo individual y es igual a la contribución promedio al conjunto de genes de la siguiente generación que realizan los individuos del genotipo o fenotipo especificado.
Expresividad - Expressivity
Es la fuerza o grado con el que se manifiesta un gen particular en el fenotipo.
F
Fenocopia - Phenocopy
Variación en el fenotipo no hereditaria (generalmente referido a un único rasgo) que es causado por condiciones ambientales. Imita a un fenotipo producido por un genotipo específico. No es un tipo de mutación, ya que no es hereditaria.
Fenotipo - Phenotype
Características físicas y/o bioquímicas observables de la expresión de uno o varios genes. Conjunto de rasgos clínicos de un individuo con un genotipo determinado.

Algunas implicaciones clínicas
En algunas patologías, numerosos genotipos pueden dar lugar a un fenotipo similar debido a heterogeneidad alélica y/o de locus.
En algunas enfermedades, puede observarse una gran variabilidad fenotípica entre individuos que tienen un genotipo idéntico, es decir, la correlación genotipo-fenotipo es baja (véase expresividad variable).
G
Gen dominante - Dominant gene
Gen que produce un efecto (o fenotipo) en el organismo independientemente del estado del alelo correspondiente.
Genómica - Genomics
La genómica se encarga del estudio de los genomas. Se considera a un genoma como el conjunto de información genética (ADN) de un organismo. A diferencia de la genética clásica, en la que a partir de un fenotipo se busca el o los genes responsables de dicho fenotipo, la genómica tiene como objetivo predecir la función de los genes a partir de su secuencia. Para conseguir este tipo de objetivos emplea herramientas basadas en análisis genéticos masivos (del orden de miles de genes) frecuentemente de forma simultánea (en un reducido número de experimentos).
H
Heterogeneidad alélica - Allelic heterogeneity (sinónimo: heterogeneidad molecular)
Heterogeneidad de locus - Locus heterogeneity
Situación en que las mutaciones producidas en Genes que se encuentran en diferentes loci cromosómicos dan lugar al mismo Fenotipo.
Ejemplo de heterogeneidad de locus: Retinitis pigmentosa (RP)
Fenotipo: Las anomalías de los fotorreceptores (bastoncillos y conos) de la retina dan lugar a una adaptación inadecuada a la oscuridad, causan pérdida de visión periférica y finalmente pérdida progresiva de visión.
Loci: Las mutaciones producidas en los genes en más de 35 loci diferentes dan lugar a retinitis pigmentosa no sindrómica que es clínicamnete indistinguible, por lo que no es posible deducir el gen alterado basándose sólo en el exámen ocular
Comparar y contrastar el concepto de heterogeneidad de locus con lo siguiente:
Heterogeneidad alélica: Un solo fenotipo originado por diferentes mutaciones en el mismo gen y locus cromosómico (Nota: algunos trastornos muestran heterogeneidad de locus, otros heterogeneidad alélica y otros ambas características)
Expresividad: Variación de las manifestaciones clínicas (tipo y severidad) de una enfermedad genética entre individuos que presentan la misma alteración genética, incluso dentro de la misma familia.
(Nota: La heterogeneidad de locus implica que los individuos con diferentes genotipos tienen el mismo fenotipo; mientras que la expresividad variable implica que los individuos con el mismo genotipo presenten un fenotipo que muestra diferencias tanto en la severidad como en la edad de comienzo de sus manifestaciones).
Heterogeneidad genética - Locus heterogeneity
Situación en que las mutaciones producidas en genes distintos dan lugar al mismo fenotipo.
Fenotipo: Las anomalías de los fotorreceptores (bastoncillos y conos) de la retina dan lugar a una adaptación inadecuada a la oscuridad, causan pérdida de visión periférica y finalmente pérdida progresiva de visión.
Loci implicados: mutaciones producidas en más de 35 genes diferentes dan lugar a retinitis pigmentosa no sindrómica, que es clínicamente indistinguible. A esto se debe que no sea posible deducir qué gen es el alterado basándose sólo en el examen ocular.

Heterogeneidad alélica: Un solo fenotipo originado por diferentes mutaciones en el mismo gen y locus cromosómico. (Nota: algunos trastornos muestran heterogeneidad genética, otros heterogeneidad alélica y otros ambas características).
Expresividad variable: variación de las manifestaciones clínicas (tipo y severidad) de una enfermedad genética entre individuos que presentan la misma alteración genética, incluso dentro de la misma familia.
(Nota: La heterogeneidad genética implica que los individuos con diferentes genotipos tienen el mismo fenotipo, mientras que la expresividad variable implica que los individuos con el mismo genotipo presenten un fenotipo que muestra diferencias tanto en la severidad como en la edad de comienzo de sus manifestaciones).
I
Inversión - Inversion
Reordenamientos cromosómicos en los que un segmento de un cromosoma se invierte totalmente y se reinserta en el mismo sitio de rotura del cromosoma. Las inversiones equilibradas (sin pérdida ni adición neta de material genético) no suelen estar asociadas con anomalías fenotípicas; sin embargo, en algunos casos, las alteraciones de un gen en los puntos de rotura pueden causar efectos fenotípicos adversos, incluyendo algunas enfermedades genéticas conocidas. Las inversiones no equilibradas (con pérdida o adición de material cromosómico) casi siempre dan lugar a un fenotipo anormal.
J
K
L
Ligado al sexo - Sex-linked
Fenotipo que se expresa solo en individuos de un determinado sexo.
Ligado al X - X-linked
Fenotipo determinado por un gen localizado en el cromosoma X.
Ligado al Y - Y-linked
Fenotipo determinado por un gen localizado en el cromosoma Y.
Limitado por el sexo - Sex-limited
Fenotipos diferentes según el sexo a pesar de tener el mismo genotipo. Ello es debido a genes que están presentes en ambos sexos de especies que se reproducen sexualmente pero que se expresan en un solo sexo y permanecen "desactivados" en el otro.
Línea - Line
Grupo de organismos diploides o poliploides, de reproducción pura, idénticos, distinguidos de otros individuos de la misma especie por algún fenotipo y genotipo únicos.
M
N
Ñ
O
P
Patrón de herencia mendeliano - Mendelian inheritance pattern
Característicos de organismos que se reproducen sexualmente. Gregor Mendel describió dos tipos de “factores” (genes) conforme a su expresión sobre el fenotipo: los dominantes y los recesivos. Si además tenemos en cuenta que los individuos de sexo femenino tienen dos cromosomas X, y los del sexo masculino una X y una Y, los modos de transmisión de los caracteres de una mutación, son un total de cuatro.
Portador sintomático - Manifesting carrier
Individuo que en un locus determinado presenta un alelo recesivo patológico en un cromosoma y un alelo normal en el otro cromosoma y que manifiesta algunos síntomas de la enfermedad. Este término se usa con frecuencia para portadoras de una mutación recesiva ligada al cromosoma X que manifiestan signos de la enfermedad, aunque su fenotipo suele ser menos severo que el de los varones con la misma mutación.
Aunque con algunas excepciones, los portadores de una mutación patológica recesiva por regla general no manifiestan síntomas clínicos de la enfermedad. Sin embargo, los portadores de mutaciones recesivas ligadas al cromosoma X presentan ocasionalmente algunas manifestaciones clínicas de la enfermedad, por lo que se les denomina portadores sintomáticos. Se supone que el mecanismo subyacente en los portadores sintomáticos es una inactivación sesgada o no aleatoria del cromosoma X, de tal manera que en la mayoría de las células el cromosoma X activo es el que tiene la mutación.
Ejemplos de enfermedades ligadas al cromosoma X en las que son frecuentes las portadoras sintomáticas:
Hemofilia A: Tiempo de coagulación prolongado, hemorragia excesiva durante intervenciones quirúrgicas menores y menstruaciones abundantes.
Distrofia muscular de Duchenne: Debilidad muscular, hipertrofia de pantorrillas leve y/o miocardiopatía dilatada.
Síndrome X frágil (mutación con penetrancia completa): Retraso mental.
Q
R
Rasgo - Trait
Recesivo ligado al cromosoma X - X-linked recessive
Modo de herencia en el que una mutación en un gen del cromosoma X hace que el fenotipo esté expresado en varones que son hemicigóticos para la mutación del gen (es decir, sólo tienen un cromosoma X) y en mujeres que son homocigóticas para la mutación (es decir, presentan una copia de la mutación del gen en cada uno de los dos cromosomas X). Los Portadores femeninos que tienen una sola copia de la mutación no suelen expresar el fenotipo, aunque las diferencias en la inactivación del cromosoma X pueden dar lugar a distintos grados de expresión clínica en estos portadores.
Árbol genealógico que representa el patrón de herencia recesiva ligada al cromosoma X.

S
T
U
V
Variante alélica de significado desconocido - Allelic variant of unknown significance
Alteración de la secuencia normal de un gen, cuyo significado no está claro hasta realizar un estudio adicional del genotipo y de su correspondiente fenotipo en una población suficientemente amplia; la secuenciación completa de un gen permite identificar generalmente numerosas (a veces cientos) variantes alélicas de un gen determinado.
Ejemplos de variantes alélicas:
· Variante alélica normal: Cambio (mutación) que no interfiere en la función normal del gen y está asociado con un fenotipo normal; se conoce también como polimorfismo benigno. Nota: En GeneReviews, la composición del gen con función normal se describe generalmente bajo este epígrafe en el texto, lo que implica que los alelos salvajes y los polimorfismos benignos se incluyan en la misma categoría; sin embargo, el término “variante” implica técnicamente un cambio con respecto al tipo salvaje.
· Variante alélica patológica: Cambio (mutación) que altera la función normal del gen y da lugar a un fenotipo anormal; se conoce también como mutación patológica.
· Variante alélica de significado desconocido: Cambio (mutación) cuyo resultado es un fenotipo desconocido. Nota: Las variantes alélicas de significado desconocido deben ser estudiadas en poblaciones amplias, para determinar si se pueden clasificar definitivamente como variantes alélicas normales o patológicas.
Es probable que la secuenciación completa de cualquier gen revele numerosas variantes alélicas. Consideremos los ejemplos siguientes:
· Gen CFTR asociado a fibrosis quística: Se han documentado más de 2000 variantes alélicas con más de 900 mutaciones patológicas conocidas.
· Gen PAH asociado a fenilcetonuria: Se han documentado más de 3000 variantes alélicas con más de 400 mutaciones patológicas conocidas.
· Gen BRCA1 asociado a cáncer de mama y de ovario: Se han documentado más de 600 variantes alélicas de las cuales aproximadamente un tercio son de significado clínico desconocido.

