Glosario de genética

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F

F1 -

Progenie de la primera generación filial de un cruce.

F2 -

Progenie de la segunda generación filial de un cruce, producida por el entrecruzamiento de individuos de la F1.

Factor de transcripción - Transcription factor

Proteína que facilita o da inicio a la transcripción de uno o varios genes.

Falso negativo - False negative 

Resultado de una prueba que indica que un individuo no está afectado y/o no presenta una mutación génica determinada, cuando en realidad está afectado y/o presenta tal mutación; es decir, cuando el resultado de una prueba realizada en un individuo afectado es negativo.

Falso positivo - False positive

Resultado de una prueba que indica que un individuo está afectado y/o presenta una mutación génica determinada, cuando en realidad no está afectado y/o no presenta tal mutación; es decir, cuando el resultado de una prueba realizada en un individuo que realmente no está afectado es positivo.

Familia génica - Gene family

Conjunto de genes similares originados por duplicación a partir de un gen ancestral común. Generalmente tienen funciones bioquímicas similares.

Familiar - Familial

Una característica o condición que tiende a ser heredada en familias.

Farmacogenética - Pharmacogenetics

Disciplina genética que se ocupa de investigar el vínculo entre la constitución genética de las personas y su respuesta a xenobióticos (drogas). Su método de investigación tiene una hipótesis definida a priori: está basado en el análisis de marcadores genéticos predeterminados de los que sospecha previamente que tengan una incidencia directa sobre el metabolismo de las drogas.

El concepto de farmacogenética surge de la observación clínica de que existían pacientes a los que, tras administrarles una determinada droga, la concentración observada en plasma u orina era anormalmente variable. Tras realizar en esos pacientes pruebas bioquímicas y metabólicas se demostraba que estas variaciones tienen origen genético. Su principal objetivo es poder anticipar la efectividad del tratamiento indicado a cada individuo y minimizar, simultáneamente, los eventos adversos.

Farmacogenómica - Pharmacogenomics

Disciplina genética que se ocupa de investigar las diferentes reacciones de los individuos a los fármacos basándose en los patrones genéticos de cada uno. Su método de investigación está basado en una aproximación distinta a la farmacogenética. No hay hipótesis a priori sobre marcadores genéticos candidatos. Se utilizan abordajes que tienen en cuenta las características de las secuencias genómicas (de miles de genes o marcadores), mediante una visión integradora que incluiría interacciones entre genes El objetivo de la farmacogenómica (también compartido por la farmacogenética) es la creación de fármacos a medida para cada paciente y adaptados a sus condiciones genéticas.

Fenilalanina - Phenylalanine

La fenilalanina es un aminoácido (abreviado frecuentemente como Phe o F). Se encuentra en las proteínas como L-fenilalanina (LFA), siendo uno de los 10 aminoácidos esenciales para el ser humano. Los codones que la expresan son UUC y UUU.

Fenocopia - Phenocopy

Variación en el fenotipo no hereditaria (generalmente referido a un único rasgo) que es causado por condiciones ambientales. Imita a un fenotipo producido por un genotipo específico. No es un tipo de mutación, ya que no es hereditaria.

Fenotipaje o tipificación fenotípica - Phenotyping

Clasificación de la diferencias fenotípicas entre individuos con la intención de inferir el genotipo.

Fenotipo - Phenotype

Características físicas y/o bioquímicas observables de la expresión de uno o varios genes. Conjunto de rasgos clínicos de un individuo con un genotipo determinado.


 

Algunas implicaciones clínicas

En algunas patologías, numerosos genotipos pueden dar lugar a un fenotipo similar debido a heterogeneidad alélica y/o de locus.

En algunas enfermedades, puede observarse una gran variabilidad fenotípica entre individuos que tienen un genotipo idéntico, es decir, la correlación genotipo-fenotipo es baja (véase expresividad variable).

 

 

FISH - Fluorescent in situ hybridization (sinónimo: hibridación in situ con fluorescencia)

Técnica que se utiliza para identificar, en una muestra problema, la presencia de cromosomas determinados o regiones específicas de cromosomas cuya secuencia es conocida, (sondas de ADN), y que marcamos con fluorescencia. La detección se realiza tras la hibridación (reconocimiento de la secuencia y emparejamiento base a base) de la Sonda de ADN marcada sobre el ADN cromosómico desnaturalizado de la muestra problema.

1ª fase. Preparación de la sonda. Una sonda es un segmento de ADN marcado con fluorescencia que es complementario a la región cromosómica de interés.



2ª fase. Hibridación. Los cromosomas desnaturalizados, fijados en el portaobjetos del microscopio, son expuestos a la sonda marcada con fluorescencia. La hibridación (fusión) tiene lugar entre la sonda y el ADN cromosómico complementario (es decir, se acopla).



3ª fase. Visualización. Tras la hibridación, se examina el portaobjetos al microscopio con luz fluorescente. Las señales fluorescentes indican la presencia de ADN cromosómico complementario, la ausencia de tales señales implica que no hay ADN cromosómico complementario.

FISH en interfase - Interphasic FISH

Técnica que se utiliza para identificar, en una muestra problema, la presencia de cromosomas determinados o regiones específicas de cromosomas cuya secuencia es conocida, (sondas de ADN), y que marcamos con fluorescencia. La detección se realiza tras la hibridación (reconocimiento de la secuencia y emparejamiento base a base) de la sonda de ADN marcada sobre el ADN cromosómico desnaturalizado de la muestra problema. En la FISH en interfase, las sondas se introducen en el núcleo interfásico. La FISH en interfase se utiliza, por ejemplo para detectar tipos específicos de aneuploidía en células fetales, así como determinadas deleciones, duplicaciones y otras anomalías en células tumorales. Al contrario que la FISH en metafase, la FISH en interfase no permite visualizar los cromosomas individualizados; por lo tanto, no se podrán detectar determinados reordenamientos estructurales.

FISH en metafase - Metaphase FISH

Técnica que se utiliza para identificar, en una muestra problema, la presencia de cromosomas determinados o regiones específicas de cromosomas cuya secuencia es conocida, (sondas de ADN, y que marcamos con fluorescencia). La detección se realiza tras la hibridación (reconocimiento de la secuencia y emparejamiento base a base) de la sonda de ADN marcada sobre el ADN cromosómico desnaturalizado de la muestra problema. En la FISH en metafase, se utiliza como muestra cromosomas obtenidos a partir de células en mitosis. La división celular tiene varias fases y en la fase denominada metafase, los cromosomas se condensan y se pueden distinguir de forma individual. Al contrario que la FISH en interfase, la FISH en metafase permite visualizar la hibridación de las sondas de ADN marcado sobre cromosomas individualizados, lo que facilita la localización de la anomalía en el cromosoma específico en el que se produce.

FISH subtelomérica - Subtelomeric FISH

Técnica en la que se utilizan sondas de ADN específicas para las áreas subteloméricas de los brazos largos y cortos de cada cromosoma, que permite la detección de deleciones y translocaciones subteloméricas crípticas y submicroscópicas, que pueden ser causa de retraso mental.

Flujo genético - Gene flow

Intercambio o transferencia de variación genética entre dos poblaciones de la misma especie. Origina cambios en las frecuencias alélicas de ambas poblaciones, y es una posible causa de evolución. Se produce como resultado de la migración.

Footprinting - Footprinting

Técnica empleada para la identificación de secuencias de ADN que ligan proteínas específicas. Al unirse la proteína ésta protege algunos enlaces fosfodiesteres del ADN y por lo tanto también protege de la acción de ADNasas.

Frecuencia alélica - Allele frequency (sinónimo: frecuencia génica)

Proporción de individuos de una población que han heredado una mutación o variante génica específica.

Frecuencia de portadores - Carrier rate 

Proporción de individuos en una población que tienen una sola copia de una variante genética (mutación o polimorfismo).

Los individuos portadores de una sola mutación de un gen recesivo no se pueden identificar normalmente por su fenotipo (es decir, no están afectados); la frecuencia de portadores se puede calcular utilizando la ley de Hardy-Weinberg cuando se conoce la incidencia de la enfermedad (es decir, la frecuencia de homocigotos).


 
Cálculo de la tasa de portadores (2pq) para una enfermedad autosómica recesiva utilizando la ley de Hardy-Weinberg cuando se conoce la frecuencia de la enfermedad (q2):

Frecuencia de la enfermedad (q2)=1/2000; Puesto que p+q = 1; p =1-0,022 = 0,978.

Por lo tanto, 2pq = 2(0,978)(0,022) = 0,043 o aproximadamente 4%.

La tasa de portadores de esta enfermedad recesiva en particular es de aproximadamente un 4% o de 1 entre 25 individuos, dada una frecuencia o incidencia de la patología en esta población de 1 entre 2000.

Las tasas de portadores se pueden determinar de forma similar en enfermedades recesivas ligadas al cromosoma X.

Frecuencia de recombinación - Recombination frequency

Parámetro genético que se emplea como indicador cuantitativo de la distancia que existe entre dos loci dados. Se mide en centiMorgan (cM).

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Autores:

Javier Benítez
Director del Programa de Genética del Cáncer Humano. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Anna Gonzalez-Neira
Human Genotyping Core Unit. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Núria Malats
Grupo de Epidemiología Genética y Molecular. Programa de Genética del Cáncer Humano. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Ana Osorio
Programa de genética del cáncer humano. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Mercedes Robledo
Jefa de grupo de Cáncer endocrino hereditario. Programa de genética del cancer humano. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Sandra Rodríguez
Molecular Cytogenetics Group. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Miguel Urioste
Unidad Clínica de Cáncer Familiar. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)


Todos ellos miembros del Programa de Genética del Cáncer Humano del