Cebador que se une a los extremos 5´y 3´ de cada fragmento de ADN en una librería de secuenciación. Actúa en la amplificación y secuenciación del ácido nucleico adyacente.

Una de las cuatro bases que componen el ADN. Las otras tres son citosina, guanina y timina. La adenina siempre se empareja con la timina y en el ARN con el uracilo.

Es la molécula portadora la información genética, que posibilita su transmisión de una generación a la siguiente.

ADN complementario, generado a partir del molde de ARN, mediante la retrotranscripción del ARNm maduro.

En bioinformática, ordenación de diferentes (dos o más) secuencias de ADN, ARN o proteínas con el objetivo de identificar similitudes o diferencias.

Cualquier cambio producido en el adn[o mas concretamente en un gen con respecto a su estado natural. Si no tiene repercusión clínica se denomina polimorfismo; cuando se trata de un cambio que tiene o puede tener repercusión clínica se suele denominar mutación. Cuando no se conoce si el cambio tiene o no repercusión clínica se habla de cambio o variante de significado desconocido.

Secuencias de ADN repetidas distribuidas a lo largo del genoma. Son las secuencias repetidas más frecuentes, representando el 5% del genoma humano. Su nombre se debe a que son reconocidas y cortadas por la enzima de restricción Alu.

Fragmento de ADN amplificado por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) o cualquier otro proceso que dé lugar a la producción de diferentes copias de ese fragmento.

Cualquier proceso que causa la replicación de una secuencia concreta de ADN en cantidad desproporcionadamente elevada.

Generación de copias in situ de una molécula específica de ADN en un soporte sólido cubierto de cebadores.

Pruebas que implican el estudio de ADN mediante un análisis de ligamiento, secuenciación o cualquiera de los diferentes métodos utilizados para la detección de mutaciones.

Método para determinar la cantidad de diversos componentes, incluyendo ADN, ARN y proteínas, por comparación con un estándar conocido; se puede utilizar para determinar el número de copias de una secuencia de ADN (es decir, para investigar posibles mutaciones por duplicación y deleción), mediante la comparación visual de la intensidad de las bandas o la cuantificación numérica con densitometría. Si un gen presenta copias adicionales, la intensidad es de más del 100% en el gel o película; mientras que si se ha perdido una copia del gen, la intensidad es de aproximadamente un 50%.

Estudio de los fragmentos de  ADN de tamaño previsible originados por la digestión (corte) de una cadena de ADN por una enzima de restricción específica. Las alteraciones (mutaciones o polimorfismos) producidas en la secuencia de ADN que destruyen o crean nuevos sitios de corte en el ADN, modifican el tamaño (y el número) de los fragmentos de ADN resultantes de la digestión por una enzima de restricción específica.

Estudio de los polimorfismos de las secuencias de ADN (variantes normales) que están próximos a/o dentro de un gen de interés (ligamiento) para identificar, en una misma familia, la segregación de una mutación patológica en un gen determinado.

La hibridación genómica comparada realizada sobre matrices de adn que permite la detección simultánea de variaciones submicroscópicas en el número de copias de ADN o en la expresión de uno o múltiples genes a lo largo de todo el genoma.

Métodos utilizados para evaluar el estado de metilación de un gen (unión de los grupos metilo a las citosinas del ADN). Los genes metilados no se expresan. La metilación desempeña un papel importante en la inactivación del cromosoma X y en la impronta genética.

Uso de secuencias repetitivas muy variables, que se encuentran en las regiones microsatélites adyacentes a los genes o intragénicas o en otras áreas de interés, como marcadores para el análisis de ligamiento, huellas moleculares de adn u otras aplicaciones diagnósticas.

Proceso mediante el cual se determina la secuencia de nucleótidos en un segmento de ADN.

Algunas implicaciones clínicas

Se puede secuenciar un gen completo, pero la mayoría de las veces se secuencian sólo regiones específicas del gen que muy probablemente contendrán mutaciones (p. ej. los exones y los límites entre los intrones y los exones).

Al secuenciar un segmento de ADN, se identifican la mayoría de las variaciones producidas con respecto a la secuencia normal (por el contrario, el análisis mutacional identifica sólo mutaciones específicas en un segmento determinado de ADN).

Tipos de alteraciones de las secuencias que se pueden detectar:

Alteraciones de secuencia descritas en la literatura como patógenas

Alteraciones de secuencias previsiblemente patógenas, pero no descritas en la literatura

Alteraciones de secuencias de significación clínica imprevisible

Alteraciones de secuencias previsiblemente benignas, pero no descritas en la literatura

Alteraciones de secuencias benignas descritas en la literatura

Posibilidades en caso de que no se detecten alteraciones de las secuencias:

El paciente no presenta una mutación en el gen analizado (p. ej. hay una alteración de la secuencia en otro gen, en un locus diferente)

El paciente presenta una alteración de la secuencia que no se puede detectar mediante el análisis de secuencias (p. ej. deleción de tamaño grande)

El paciente presenta una alteración de la secuencia en una región del gen (p. ej. una región intrónica o reguladora) que no se ha detectado en el análisis de laboratorio

1Adaptado de ACGM Recommendations for Standards for Interpretation of Sequence Variations (2000)

Método utilizado para identificar las proteínas que se acortan (truncan) a consecuencia de mutaciones que causan específicamente la terminación prematura del proceso de traducción del ARNm.

Estudio de genética molecular para identificar un conjunto de segmentos de adn que están estrechamente relacionados en su modo de herencia (ligados). Se utiliza en el análisis de ligamiento o cuando un rasgo o característica determinados presentan desequilibrio de ligamiento con un marcador genético o un grupo de [GLOSARIO]marcador[FIN_GLOSARIO]es.

Análisis utilizado para especificar si un individuo ha heredado determinado cromosoma o segmento de adn de la madre o del padre. Resulta importante en el diagnóstico de enfermedades en relacionadas con la impronta genética o causadas por disomía uniparental.

La utilización de técnicas de secuenciación, análisis mutacional, rastreo de mutaciones o cualquier otro medio de estudio molecular genético, para detectar variantes en un gen que pueden estar asociadas a trastornos genéticos específicos. El análisis directo del adn es posible sólo cuando se conoce el gen o genes o la región genómica, asociados con la enfermedad.

La arginina (arg o R) es uno de los 20 aminoácidos que se encuentran formando parte de las proteínas. Es un aminoácido condicionalmente esencial (se necesita en la dieta solo bajo ciertas condiciones), y puede estimular la función inmunológica al aumentar el número de leucocitos. La arginina está involucrada en la síntesis de creatina, poliaminas y en el ADN. En el ARNm está codificado por los codones CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, y AGG.

Es el ácido ribonucleico que transfiere el código genético procedente del núcleo celular a un ribosoma en el citoplasma. Se forma durante el proceso de transcripción del ADN al ARN, durante el cual la ARN polimerasa debe unirse al ADN con ayuda de cofactores de transcripción. El proceso de transcripción se lleva a cabo en el núcleo en eucariotas y en el citoplasma en procariotas.

Proyecto internacional iniciado en el año 2005 con el objetivo de catalogar los cambios moleculares, a nivel de ADN, ARN, proteico y epigenético, existentes en los diferentes tipos de tumores mediante plataformas de análisis masivo y potentes análisis bioinformáticos. Con este proyecto se pretende mejorar el diagnóstico y el tratamiento de los pacientes oncológicos además de proporcionar información para prevenir y entender cuáles son los mecanismos moleculares asociados al desarrollo de esta enfermedad (https://cancergenome.nih.gov/)

Segmento grande de ADN, generalmente constituido por 100.000-200.000 bases, de cualquier especie que es clonado e introducido en una bacteria. Una vez dentro de la bacteria, pueden obtenerse múltiples copias del mismo.

Proceso de almacenaje durante un periodo indefinido del adn extraído de cualquiera de las posibles fuentes celulares, conservado bajo congelación o refrigeración para futuros análisis.

Cualquiera de los compuestos químicos nitrogenados que constituyen los ácidos nucléicos. Existen dos tipos de bases nitrogenadas: purinas, (adenina y guanina); y pirimidinas (citosina y timina en el adn y uracilo en el ARN).

Colección de secuencias de adn generadas a partir de la secuencia del ARN mensajero (mARN). Estas librerías contienen sólo adn codificante de proteínas (genes), quedando excluídas las secuencias de adn que no codifican.

Una secuencia corta de oligonucleótidos que se utiliza en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para la creación de moléculas más largas de ADN.

Tecnología que utiliza la interacción entre ADN y proteínas en la célula. Se utiliza para purificar regiones específicas de ADN que se encuentran unidas a proteínas en la célula. Tras purificar los complejos ADN-proteína, el ADN puede ser aislado y secuenciado (ChIP Seq).

Una de las cuatro bases que componen el ADN. Las otras tres son adenina, guanina y timina. La citosina siempre se empareja con la guanina.

Copia idéntica de una secuencia de ADN, o de todo un gen, o de un ser vivo. Una o más células derivadas de un solo antecesor e idénticas a éste.

Aislar un gen o una secuencia específica de ADN.

En el adn o ARN, secuencia de tres nucleótidos que codifica determinado aminoácido o indica el comienzo o la terminación del proceso de traducción (codón de inicio, parada o terminación).

Transferencia de secuencias de ADN entre dos genes muy similares, que se produce la mayoría de las veces por un entrecruzamiento desigual durante la meiosis. Puede ser un mecanismo que da lugar a una mutación si la transferencia de material altera la secuencia codificadora del gen o si el mismo material transferido contiene una o más mutaciones.

Las dos cadenas paralelas de cromatina conectadas en el centrómero que constituyen el cromosoma después de la replicación del ADN.

Estructura física, también llamada cromatina, que consiste en una molécula de adn compactado organizada en genes y mantenida por proteínas llamadas histonas.

Tipo de técnica de rastreo de mutaciones que consiste en el análisis de un segmento de ADN para detectar errores de emparejamiento entre pares de bases normales y mutados.

Alteración genética consistente en la pérdida de un segmento de ADN. Su magnitud es variable, pudiendo ser tan pequeñas como un solo par de bases o tan grandes que afecten a uno  o más genes.

Método para identificar la dosis o la expresión génica mediante la medición de la absorción de la luz en una autorradiografía (película) de una banda (o mancha) que representa el ADN, el ARN o una muestra de proteínas. Es una técnica útil para detectar mutaciones por duplicación y mutaciones por deleción heterocigótica.

En una población, la herencia simultánea y transmitida de un conjunto de marcadores de adn específicos a lo largo de generaciones sucesivas sin que se produzca recombinación entre ellos.

Técnica de electroforesis para muestras de adn de cadena doble que utiliza un gel en el que se crea un gradiente desnaturalizante mediante una sustancia química, por ejemplo, urea. Se emplea para la identificación de mutaciones que afectan al patrón de migración del adn en esas condiciones de electroforesis. La presencia de la mutación se detecta mediante comparación del patrón electroforético (punto de desnaturalización) de la muestra problema con la secuencia salvaje u original.

Cromatografía líquida desnaturalizante de alto rendimiento. En genética es un método utilizado para la detección de mutaciones de uno o pocos nucleótidos. La base de la técnica es la diferencia de migración que presentan fragmentos homodúplex (secuencia doble de ADN que presenta un 100% de apareamiento entre las bases) frente a los heterodúplex (apareamiento no total) durante su migración por un gradiente en una columna.

Situación en la que un par de cromosomas homólogos o algún segmento de un par de cromosomas homólogos son heredados de sólo uno de los progenitores. La disomía uniparental puede dar lugar a un fenotipo anormal en algunos casos. También se ha descrito disomía uniparental somática que afecta sólo a las células que componen un determinado tejido. En estos casos el origen de la disomía no es la herencia directa sino un proceso anómalo de replicación del ADN.

La disomía uniparental da lugar a un fenotipo anormal cuando los cromosomas implicados llevan impronta, por lo que los genes de estos cromosomas sólo tienen un alelo activo (es decir, sólo el alelo materno o paterno del par es activo).

Síndromes asociados con disomía uniparental (UPD)

Síndrome de Prader-Willi (UPD15 materno)

Síndrome de Angelman (UPD15 paterno)

Diabetes mellitus neonatal transitoria (UPD6 paterno)

Síndrome de Russell-Silver (UPD7 materno)

Síndrome de Beckwith-Wiedeman (UPD11 materno)

Síndrome de MUPD14 (UPD14 materno)

Región específica o secuencia de aminoácidos de una proteína, que está asociada a una función determinada o al segmento de adn correspondiente.

Modificación de la secuencia genética (patológica o no) consistente en la presencia de un segmento adicional de adn que da lugar a copias repetidas de una parte de un gen, un gen entero o una serie de genes. Su origen más probable es un entrecruzamiento desigual durante la replicación del segmento duplicado durante la formación de los gametos en la meiosis.

Técnica que permite a los investigadores alterar el ADN de las células u organismos para insertar, eliminar o modificar un gen o secuencia de genes para silenciar, mejorar o cambiar las características del gen.

Técnica para la separación de moléculas según la movilidad de éstas en un campo eléctrico. La separación de moléculas (proteínas, ADNs o ARNs) puede realizarse sobre un soporte sólido (ejem: acetato de celulosa), matriz porosa (ejem: gel) o disolución (electroforesis libre).

Técnica de electroforesis para muestras de ADN de cadena doble que utiliza un gel en el que se crea un gradiente desnaturalizante mediante una sustancia química, por ejemplo, urea. Se emplea para la identificación de mutaciones que afectan al patrón de migración del ADN en esas condiciones de electroforesis. La presencia de la mutación se detecta mediante comparación del patrón electroforético (punto de desnaturalización) de la muestra problema con la secuencia salvaje u original.

Técnica electroforética que consiste en el análisis de un segmento de ADN para detectar errores de emparejamiento entre pares de bases normales y mutadas (ver explicación esquemática). Se emplea para el rastreo de mutaciones.

Una enzima de restricción o endonucleasa de restricción es una enzima que escinde ADN en fragmentos en o cerca de sitios de reconocimiento específicos dentro de la molécula conocida como sitios de restricción. Las enzimas de restricción se clasifican comúnmente en cuatro tipos. Para cortar el ADN, todas las enzimas de restricción hacen dos incisiones, una a través de cada cadena principal de azúcar-fosfato (es decir, cada cadena) de la doble hélice de ADN.

Método de detección de mutaciones basado en la separación de proteínas en función del valor de pH en el que su carga neta es cero (punto isoeléctrico). Se suele utilizar conjuntamente con la técnica western blot para permitir la identificación de productos proteicos de tipo salvaje frente a mutante. La alteración de una secuencia de adn que dé lugar a una sustitución de aminoácidos puede variar el punto isoeléctrico de una proteína.

Intercambio de un segmento de adn entre los dos cromosomas homólogos durante la meiosis. Tiene como resultado una combinación nueva de material genético en el gameto.

La epidemiología genética estudia la interacción entre los factores genéticos y ambientales que dan origen a las enfermedades del ser humano. Utiliza marcadores de ADN que son estudiados mediante análisis molecular. Dado el volumen de datos (que hacen referencia a poblaciones numerosas) lo habitual es que sean almacenados en bases de datos y tratados mediante herramientas bioinformáticas. Las estrategias de investigación incluyen, entre otras, análisis de segregación familiar, asociaciones alélicas y estudios de interacción gen y medio ambiente.

Cambios reversibles de ADN (modificaciones químicas) que alteran la expresión de los genes que son objeto de los mismos. Los tipos de cambios epigenéticos más frecuentes incluyen la metilación de la citosina del ADN así como la metilación, acetilación y fosforilación de las proteínas histonas que conforman la cromatina. La metilación más estudiada es una modificación del ADN, en la que un grupo metilo es trasferido desde S-adenosilmetionina a una posición C-5 de citosina por una ADN-5 metiltransferasa. La metilación del ADN ocurre, casi exclusivamente, en dinucleótidos CpG, teniendo un importante papel en la regulación de la expresión del gen. Estos factores genéticos son determinados por el ambiente celular en lugar de por la herencia.

Mecanismo de reparación de ADN dañado que involucra la eliminación de un segmento polinucleotídico y su reemplazo por el segmento correcto.

Proceso mediante el cual se comparan las secuencias de adn para determinar si los individuos nacidos en una gestación múltiple (mellizos, trillizos, etc.) son monocigóticos (idénticos) o dicigóticos (fraternales). Estos estudios se utilizan frecuentemente para identificar un donante apropiado para trasplante de órganos o para calcular el riesgo de susceptibilidad a desarrollar una enfermedad.

Pruebas que implican el estudio del ADN, mediante análisis de ligamiento, secuenciación o detección de mutaciones, utilizando uno o varios de los diferentes métodos disponibles.

Análisis genéticos realizados en muestras tumorales que detectan la deficiencia en el sistema de reparación de errores de emparejamiento de bases del ADN. La deficiencia se manifiesta al comparar el número de repeticiones de nucleótidos en un grupo de marcadores tipo microsatélite en una muestra problema (tumor) frente al número observado en una muestra normal del mismo paciente. Se considera que hay estabilidad de microsatélites (MSS) cuando el número de repeticiones en cada marcador, tanto en el tejido tumoral como en el normal, es el mismo. Existe inestabilidad de microsatélites (MSI) cuando el número de repeticiones en el tejido tumoral y el normal es diferente.

Análisis genético cuyo objetivo es la cuantificación del número de repeticiones de grupos de tres nucleótidos en un segmento determinado de ADN.

Pruebas realizadas con objeto de confirmar o descartar una enfermedad genética conocida o que se sospecha en un individuo sintomático o, prenatalmente, en un feto con riesgo de desarrollar una patología genética específica.

Una etiqueta de secuencia expresada (o "expressed sequence tag", EST) es una subsecuencia corta de secuencia conocida dentro de una secuencia de cADN.

Secuencia codificante de ADN. El exón es la región de un gen que no se separa durante el proceso de splicing (corte y empalme) manteniéndose en el ARN mensajero.

Técnica que se utiliza para identificar, en una muestra problema, la presencia de cromosomas determinados o regiones específicas de cromosomas cuya secuencia es conocida, (sondas de ADN), y que marcamos con fluorescencia. La detección se realiza tras la hibridación (reconocimiento de la secuencia y emparejamiento base a base) de la Sonda de ADN marcada sobre el ADN cromosómico desnaturalizado de la muestra problema.

Técnica que se utiliza para identificar, en una muestra problema, la presencia de cromosomas determinados o regiones específicas de cromosomas cuya secuencia es conocida, (sondas de ADN), y que marcamos con fluorescencia. La detección se realiza tras la hibridación (reconocimiento de la secuencia y emparejamiento base a base) de la sonda de ADN marcada sobre el ADN cromosómico desnaturalizado de la muestra problema. En la FISH en interfase, las sondas se introducen en el núcleo interfásico. La FISH en interfase se utiliza, por ejemplo para detectar tipos específicos de aneuploidía en células fetales, así como determinadas deleciones, duplicaciones y otras anomalías en células tumorales. Al contrario que la FISH en metafase, la FISH en interfase no permite visualizar los cromosomas individualizados; por lo tanto, no se podrán detectar determinados reordenamientos estructurales.

Técnica que se utiliza para identificar, en una muestra problema, la presencia de cromosomas determinados o regiones específicas de cromosomas cuya secuencia es conocida, (sondas de ADN, y que marcamos con fluorescencia). La detección se realiza tras la hibridación (reconocimiento de la secuencia y emparejamiento base a base) de la sonda de ADN marcada sobre el ADN cromosómico desnaturalizado de la muestra problema. En la FISH en metafase, se utiliza como muestra cromosomas obtenidos a partir de células en mitosis. La división celular tiene varias fases y en la fase denominada metafase, los cromosomas se condensan y se pueden distinguir de forma individual. Al contrario que la FISH en interfase, la FISH en metafase permite visualizar la hibridación de las sondas de ADN marcado sobre cromosomas individualizados, lo que facilita la localización de la anomalía en el cromosoma específico en el que se produce.

Técnica en la que se utilizan sondas de ADN específicas para las áreas subteloméricas de los brazos largos y cortos de cada cromosoma, que permite la detección de deleciones y translocaciones subteloméricas crípticas y submicroscópicas, que pueden ser causa de retraso mental.

Técnica empleada para la identificación de secuencias de ADN que ligan proteínas específicas. Al unirse la proteína ésta protege algunos enlaces fosfodiesteres del ADN y por lo tanto también protege de la acción de ADNasas.

Unidad básica de la herencia que consiste en un segmento de adn que codifica una proteína específica o un segmento de una proteína (o una molécula de ARN) con una característica o función determinada.

Unión accidental del ADN de dos genes. Los genes de fusión pueden ocurrir como resultado de una translocación, deleción o inversión cromosómica. Las fusiones génicas pueden dar lugar a proteínas híbridas o a la regulación incorrecta de la unidad de transcripción de un gen por los elementos reguladores en cis (potenciadores) de otro.

Gen para el que se ha establecido su posición relativa en un segmento de ADN o en un cromosoma.

Gen cuyo producto es fácilmente detectable o medible y, por lo tanto, puede usarse como un indicador de si una construcción de ADN se ha transferido con éxito. Por ejemplo: cloranfenicol transacetilasa.

La genómica se encarga del estudio de los genomas. Se considera a un genoma como el conjunto de información genética (ADN) de un organismo. A diferencia de la genética clásica, en la que a partir de un fenotipo se busca el o los genes responsables de dicho fenotipo, la genómica tiene como objetivo predecir la función de los genes a partir de su secuencia. Para conseguir este tipo de objetivos emplea herramientas basadas en análisis genéticos masivos (del orden de miles de genes) frecuentemente de forma simultánea (en un reducido número de experimentos).

Una de las cuatro bases que componen el ADN. Las otras tres son adenina, citosina y timina. La guanina siempre se empareja con la citosina.

Segmentos cortos de ARN utilizados para dirigir la enzima de corte de ADN a la ubicación de destino en el genoma. Los segmentos de gARN contienen la región de homología con la secuencia diana (normalmente 20 bases) y una secuencia que interacciona con la nucleasa (por ejemplo, Cas9). Los gARN utilizados en la edición del genoma son sintéticos y no ocurren en la naturaleza.

Enzima que participa en el proceso de replicación de la molécula de ADN desenrrollando la doble hélice cerca del punto de bifurcación de la horquilla replicadora.

Forma compacta de ADN, que se presenta en múltiples variedades. Estas variedades se encuentran en un continuo entre los dos extremos de heterocromatina constitutiva y facultativa.

Proteínas altamente alcalinas que se encuentran en los núcleos de células eucarióticas y cuya función es el empaquetamiento y ordenamiento del ADN en unidades estructurales llamadas nucleosomas. Son los principales componentes proteicos de la cromatina, que actúan como carretes alrededor de los cuales se enrolla el ADN y desempeñan un papel en la regulación genética.

Discrepancia entre el tamaño de los microsatélites en el adn de tejido tumoral comparado con el no tumoral de la misma persona, a consecuencia de las mutaciones producidas en un gen en la vía de reparación de los errores de emparejamiento de bases del adn (MMR). Estos gen es si no estuviesen mutados corregirían normalmente estos errores.

Anomalía cromosómica en la que el material de un cromosoma se inserta en otro cromosoma; mutación en la que se inserta un segmento de ADN en un gen o en otro segmento de ADN, alterando potencialmente la secuencia codificante.

Proceso de recombinación que inserta una molécula de ADN pequeña en un locus más grande.

Secuencia no codificante de ADN que se transcribe a ARN mensajero (ARNm) en su estado inmaduro, pero es escindida del mismo al transformarse en ARNm maduro antes de la traducción.

Colección desordenada de clones de ADN de un organismo particular cuya relación entre sí puede establecerse mediante un mapeo físico.

Ubicaciones en una molécula de ADN que contiene secuencias de nucleótidos específicas (4-8 pares de bases de longitud), que son reconocidas por enzimas de restricción.

Proceso gracias al cual se determina las posiciones relativas de genes en una molécula de ADN, de un cromosoma o de un plásmido, y de la distancia, dada en unidades de ligamiento o física, que hay entre ellos.

Segmento identificable de ADN (p. ej. RFLP, VNTR, microsatélite) que al presentar una variación amplia entre los individuos, permite analizar su herencia y segregación con los alelos de un gen determinado. Se utiliza en el análisis de ligamiento.

Región polimórfica identificable de ADN (es decir, un marcador) localizada en un gen, a diferencia del marcador intragénico, que está localizado dentro de un mismo gen. Los marcadores flanqueantes se utilizan en el análisis de ligamiento para analizar la herencia del gen en cuestión.

Región polimórfica identificable de ADN (es decir, un marcador) localizado dentro de la extensión de la secuencia de un gen (es decir, intragénico), a diferencia del marcador flanqueante, que está localizado en uno de los dos lados de un gen. Los marcadores intragénicos se utilizan en el análisis de ligamiento para investigar la herencia del gen en cuestión.

Sistema de control de la integridad del ADN, en el que intervienen determinados genes, que identifica, escinde y corrige los errores de emparejamiento de las bases durante la replicación del ADN. Las mutaciones producidas en los genes responsables de este mecanismo pueden dar lugar a determinadas enfermedades genéticas y algunos tipos de cáncer.

Unidad de longitud para fragmentos de ADN que equivale a 1 millón de nucleótidos (aproximadamente 1 centimorgan, cM).

Unión de los grupos metilo a las citosinas del ADN. Se relaciona con una transcripción reducida del gen y se considera el mecanismo principal en la inactivación del cromosoma X y en la impronta genómica.

Segmentos repetitivos de ADN que comprenden de dos a cinco nucleótidos (repeticiones de dinucleótidos/trinucleótidos/ tetranucleótidos/ pentanucleótidos) dispersos por todo el genoma en las regiones no codificadoras que hay entre o dentro de los genes (intrones), se utilizan frecuentemente como marcadores en el análisis de ligamiento debido a la alta variabilidad natural existente en el número de repeticiones entre los individuos. Estas regiones son propiamente inestables y susceptibles a mutaciones.

Alteración en la secuencia del ADN causada por el cambio, inserción o deleción de un único nucleótido.

Mutación que no produce un cambio en el marco de lectura del triplete cuando se produce la transcripción de ADN a ARN mensajero. Estas mutaciones, sin embargo, pueden dar lugar a la síntesis de un producto proteico anormal si, al traducirse el ARN a proteína, el cambio de triplete supone un cambio de aminoácido.

Molécula compuesta por una base nitrogenada (adenina, guanina, timina o citosina en ADN; adenina, guanina, uracilo o citosina en ARN), un grupo fosfato y un azúcar (desoxirribosa en ADN; ribosa en ARN). El ADN y el ARN son polímeros de muchos nucleótidos.

Molécula compuesta por una base nitrogenada (adenina, guanina, timina o citosina en ADN; adenina, guanina, uracilo o citosina en ARN), un grupo fosfato y un azúcar (desoxirribosa en ADN; ribosa en ARN). El ADN y el ARN son polímeros de muchos nucleótidos.

Prueba de genética molecular empleada para la detección de una mutación específica por medio de un segmento sintético de ADN de una longitud aproximada de 20 pares de bases (oligonucleótido). El investigador diseña la secuencia específica que se une a la secuencia complementaria en una muestra de ADN problema, lo que permite su identificación.

Prueba genética en la que se analiza simultáneamente el estado de un grupo de genes asociados con una determinada patología. Son muy usados los que analizan el conjunto de genes asociados con la susceptibilidad a desarrollar cáncer colorrectal, de mama, etc., o los genes relacionados con la discapacidad intelectual. Los avances en las técnicas de secuenciación permiten analizar en un único test un número prácticamente ilimitado de genes. Frente al habitual análisis de un único gen, el uso de estos paneles se ha extendido en los años más recientes tanto en el terreno de la investigación, como en la práctica clínica ya que permiten una valoración potencialmente más completa de los riesgos derivados de la alteración de genes de susceptibilidad.

Dos bases nitrogenadas unidas mediante enlaces débiles en el ADN de cadena doble; el emparejamiento específico de estas bases (adenina con timina y guanina con citosina) facilita la replicación exacta del ADN; la cuantificación de los pares de bases (p. ej. 8 bp) se refiere a la longitud física de una secuencia de nucleótidos.

Procedimiento que genera millones de copias de un segmento corto de ADN mediante ciclos repetidos de: 1) desnaturalización del ADN, 2) acoplamiento de los oligonucleótidos y 3) extensión mediante la acción de la ADN polimerasa. La PCR es un procedimiento muy común en los estudios de genética molecular y se puede utilizar para: 1) generar una cantidad suficiente de ADN para realizar determinadas pruebas (p. ej. análisis de la secuencia, rastreo de mutaciones); o 2) puede ser una prueba diagnóstica en sí misma (por ejemplo amplificación específica del alelo, cuantificación del número de repeticiones de trinucleótidos).

Uso de PCR para determinar la cantidad de ADN o ARN en una muestra; se utiliza frecuentemente para detectar mutaciones por deleción y mutaciones por duplicación.

Es un compuesto orgánico, similar al benceno, y a la piridina pero con dos átomos de nitrógeno que sustituyen al carbono en las posiciones 1 y 3. La pirimidina tiene tres derivados que forman parte de los ácidos nucleicos: la timina, la citosina y el uracilo; las tres tienen un grupo carbonilo (C=O) en el carbono 2; las dos primeras forman parte del ADN donde se aparean con sus purinas complementarias, mientras que la última está presente solo en el ARN. En el ADN, adenina (A) y guanina (G) se emparejan con timina (T) y citosina (C), respectivamente, y en el ARN adenina se une a uracilo (U) y la guanina a citosina.

Molécula pequeña, a menudo circular, de ADN extracromosómico, cuya replicación es independiente de la del ADN cromosómico. Son comunes en bacterias y levaduras. Por lo general contienen un reducido número de genes que suele conferir ciertas ventajas al hospedador, por ejemplo, resistencia a un determinado antibiótico.

Los plásmidos se usan en ingeniería genética aprovechando su capacidad para reproducirse de manera independiente del ADN cromosómico.

Variaciones naturales producidas en un gen, secuencia de ADN, proteína o cromosoma que no tienen efectos adversos sobre el individuo y tienen lugar con una frecuencia bastante alta en la población general. El tipo de polimorfismo más común es el que afecta a un único par de bases.

Variación natural (polimórfica) de una secuencia de ADN entre los individuos. Se visualiza porque se suprimen o se crean nuevos sitios de restricción (corte) en el ADN, que cuando es digerido por una endonucleasa da lugar a fragmentos de ADN de diferente longitud.

Variación en la secuencia de ADN que implica una sola base: adenina (A), timina (T), citosina (C) o guanina (G). Son los polimorfismos genéticos más frecuentes y se considera que determinan gran parte de la variabilidad genética entre individuos. Se conocen varios millones de SNP repartidos por todos los cromosomas humanos, aproximadamente 1 cada 300-100 pares de bases. La frecuencia de un SNP en población general se sitúa por encima del 1%.

Diversas técnicas de análisis masivo del genoma se fundamentan en el estudio de miles o millones de SNP que cubren la práctica totalidad del genoma (Genome Wide Association Studies, o GWAS), para buscar la asociación de algunos de ellos con enfermedades concretas, utilizando para ello grandes números tanto de individuos enfermos, como de individuos sanos.

Técnica para el rastreo de mutaciones que identifica segmentos de ADN de cadena sencilla que muestran un patrón de migración anormal en la electroforesis en gel.

Pequeña región del ADN eucariota que puede aumentar los niveles de transcripción de un gen o un grupo de genes mediante la unión a proteínas (factores de transcripción). Las regiones enhancer no tienen por qué estar localizadas cerca de los genes sobre los que actúa, ni siquiera en el mismo cromosoma.

Secuencia corta de nucleótidos, complementaria de una de las hebras del ADN molde a partir de la cual la ADN polimerasa incorporará nuevos deoxirribonucleótidos para la síntesis de una nueva cadena de ADN.

Los genes se expresan y se transcriben a segmentos de ARN (ácido ribonucleico) que son traducidos a proteínas. El ARN y las proteínas son los productos génicos, consecuencia de la expresión del gen.

Es la primera fase de la mitosis y de la meiosis. En ella se produce la condensación de todo el material genético (ADN)-que normalmente existe en forma de cromatina condensada dentro de una estructura altamente ordenada llamada cromosoma- y el desarrollo bipolar del huso acromático. Los dos pares de centríolos migran hacia extremos opuestos de la célula, la membrana nuclear se disuelve al final de la profase y los cromosomas se anclan en los microtúbulos del huso gracias al cinetocoro que se encuentra en el centrómero.

Secuencia de ADN necesaria para activar un gen. La transcripción del gen se inicia en el promotor. Generalmente se encuentran cerca del comienzo de un gen, el promotor tiene un sitio de unión para la enzima ARN polimerasa encargada de la síntesis del ARNm.

Proceso mediante el cual se comparan secuencias de ADN de un niño y un adulto determinados para calcular la probabilidad de que los dos individuos estén emparentados. Mediante los análisis de ADN se puede descartar con seguridad, pero no confirmar absolutamente que un individuo es el padre o la madre biológicos.

Copia de un gen que carece normalmente de intrones y de otras secuencias de ADN esenciales para su función. Los pseudogenes, aunque son genéticamente similares al gen funcional original, no se expresan y frecuentemente contienen numerosas mutaciones.

Secuencias de adn muy susceptibles a mutaciones debido a una inestabilidad inherente, tendencia hacia un entrecruzamiento desigual o predisposición química a sustituciones de nucleótidos simples; región en la que se observan mutaciones con más frecuencia de la habitual.

Es una base nitrogenada, un compuesto orgánico heterocíclico aromático. La estructura de la purina está compuesta por dos anillos fusionados, uno de seis átomos y el otro de cinco. Dos de las bases de los ácidos nucleicos, adenina y guanina, son derivados de una purina. En el ADN, estas bases se unen con sus pirimidinas complementarias, la timina y la citosina, a través de enlaces de hidrógeno.

Intercambio de un segmento de ADN entre dos cromosomas homólogos durante la meiosis (aunque en algunas ocasiones se puede dar en mitosis), cuyo resultado es una combinación nueva de material genético en el gameto.

Secuencias de ADN muy susceptibles de ser mutadas debido a una inestabilidad inherente, tendencia hacia un entrecruzamiento desigual o predisposición química a sustituciones de nucleótidos simples; región en la que se observan mutaciones con más frecuencia de la habitual.

Región cromosómica más cercana al telómero (cada uno de los extremos del romosoma) que está compuesta por secuencias repetitivas de ADN muy polimórficas, situadas típicamente en las proximidades de las áreas ricas en genes. Las microdeleciones y las reordenamientos sutiles que alteran los genes en las regiones subteloméricas pueden causar retraso mental; para detectar estas anomalías normalmente es necesario utilizar hibridación fluorescente in situ (FISH) o arrays de CGH, que permiten una evaluación más detallada de las regiones subteloméricas.

Ordenación lineal de múltiples copias de secuencias cortas repetidas de ADN, de longitud variable pero mayores de tres bases, y muy polimórficas, por lo que resultan útiles como marcadores en el análisis de ligamiento.

La replicación del ADN es el proceso mediante el cual se duplica una molécula (sintetiza una copia idéntica) de ADN. Cuando una célula se divide, en primer lugar, debe duplicar su genoma para que cada célula hija contenga un juego completo de cromosomas. De esta manera se garantiza la transmisión de la información genética.

Es el conjunto de métodos que tienen por objetivo determinar el orden exacto de los nucleótidos (A, C, G y T) en la molécula de ADN. La secuencia de bases de ADN lleva la información que una célula necesita para originar moléculas de ARN y proteínas. Los avances en las técnicas de secuenciación de ADN han sido muy notables en los años recientes gracias al Proyecto Genoma Humano. Es posible aplicar estas técnicas para conocer la secuencia de un único gen, de varios genes (paneles), al conjunto de genes de un individuo (exoma) o, finalmente a todo el genoma de un individuo.

Síndrome causado por una deleción cromosómica que comprende varios genes y es demasiado pequeña para poder ser detectada al microscopio utilizando métodos citogenéticos convencionales. Dependiendo del tamaño de la deleción, se pueden utilizar ocasionalmente otras técnicas, tales como FISH u otros métodos de análisis de ADN, para su identificación.

Secuencia de ADN que es reconocida por una endonucleasa (una proteína que corta el ADN) como el lugar en el que se cortará el ADN, o también llamado "diana de corte".

Variación en la secuencia del adn (con respecto a una secuencia consenso) que afecta a una única base (A,T,G,C) en posiciones concretas del genoma (1 cada 1000 bases en promedio), y que se observa en la población con una frecuencia de al menos 1%. En la especie humana se estima que existen en torno a de 12 millones de SNPs, de los que a finales de 2007 se han identificado algo más de un tercio.

Emparejamiento incorrecto e intercambio de ADN entre regiones de cromosomas homólogos o no homólogos, pero genéticamente similares, que da lugar a la duplicación o deleción del ADN en las células hijas.

Secuencia específica de ADN o ARN prefabricada, que se marca con uno de los diversos métodos disponibles y se utiliza para detectar la presencia de una secuencia complementaria cuando se une (hibrida) a ella.

Técnica de análisis de genética molecular que se utiliza para detectar diferencias en la longitud de los fragmentos de ADN tras ser digeridos por enzimas de restricción (lo que se conoce normalmente como RFLP: polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción). La longitud de los fragmentos de restricción es variable en tamaño, desde pocas bases a kilobases.

Es el cambio o sustitución de una base por otra en la secuencia de ADN. Se conoce como “transición” cuando la base cambia por otra del mismo tipo: purina (A y G) por purina o pirimidina (C y T) por pirimidina. En la “transversión” el cambio es de una purina por una pirimidina o de una pirimidina por una purina.

La tasa de mutación de un gen o una secuencia de ADN es la frecuencia en la que se producen nuevas mutaciones en ese gen o la secuencia en cada generación.

Es la cuarta y última fase de la mitosis celular. Es la reversión de los procesos que tuvieron lugar durante la profase y prometafase. Los cromosomas ya están separados en dos grupos de cromátidas en los dos extremos de la célula. Las cromátidas se desenrollan y el ADN vuelve a tomar forma de hilos de cromatina difusa. Se crea alrededor de cada grupo una membrana nuclear. El huso mitótico desaparece.

Los telómeros son los extremos de los cromosomas. Son regiones de ADN no codificante, altamente repetitivas (5'-TTAGGG-3') cuya función principal es la estabilidad estructural de los cromosomas en las células eucariotas, la división celular y el tiempo de vida de las estirpes celulares.

También llamada temperatura de fusión del ADN es la temperatura en la cual el 50% del ADN tiene sus hebras separadas (desnaturalización del ADN).

Hebra del ADN dúplex que actúa como molde para la transcripción.

También conocido como máquina de PCR es un instrumento usado en biología molecular que permite realizar de forma automatizada y secuencial los ciclos de temperaturas necesarios para llevar a cabo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de amplificación de ADN.

Es una de las cinco bases nitrogenadas constituyentes de los ácidos nucleicos (las otras cuatro son la adenina, la guanina, la citosina, y el uracilo, este último sólo presente en el ARN). Es un compuesto heterocíclico derivado de la pirimidina que parte del ADN y en el código genético se representa con la letra T.

Es la síntesis enzimática de ARN utilizando un templado de ADN. Es el primer proceso de la expresión génica donde se transfiere la información contenida en la secuencia del ADN hacia la secuencia de la proteína utilizando diversos ARN como intermediarios. Esta secuencia de ADN es copiada a ARN con una enzima llamada ARN polimerasa que sintetiza ARN mensajero que contiene la información de la secuencia del ADN. Este proceso también podría llamarse síntesis del ARN mensajero.

También llamada retrotranscriptasa es una enzima de tipo ADN-polimerasa, codificada por retrovirus, cuya función es sintetizar ADN de doble cadena utilizando como templado una molécula de ARN monocatenario, es decir, catalizar la retrotranscripción o transcripción inversa.

Término general utilizado para referirse a la introducción de ADN exógeno al interior de una célula eucariota.

Transferencia de material genético, que puede comprender desde un pequeño segmento de adn hasta un genoma entero, de una célula humana a otro tipo de célula en cultivo para estudiar la frecuencia con que los marcadores genéticos conocidos son transferidos conjuntamente al genoma receptor; se utiliza para determinar la proximidad física de los marcadores genéticos en el genoma humano; se utiliza asimismo para estudiar la expresión y regulación génica.

Célula u organismo que contiene en su línea germinal un ADN exógeno introducido experimentalmente.

Son regiones de ADN (200-2000 pares de bases) capaces de moverse de manera autosuficiente de una parte a otra parte del genoma, mediante un mecanismo de corta-pega y cuya consecuencia es la producción de mutaciones.

Es un concepto muy amplio que engloba a cualquier segmento de ADN transcrito a un único ARN, independiente del número de genes de los que contenga información.

Es una pirimidina, una de las cuatro bases nitrogenadas que forman parte del ARN y en el código genético se representa con la letra U. El uracilo reemplaza en el ARN a la timina que es una de las cuatro bases nitrogenadas que forman el ADN. Al igual que la timina, el uracilo siempre se empareja con la adenina mediante dos puentes de hidrógeno, pero le falta el grupo metilo.

La valina (abreviada Val o V) es uno de los veinte aminoácidos codificados por el ADN. En el ARN mensajero, está codificada por GUA, GUG, GUU o GUC. Nutricionalmente, en humanos, es uno de los aminoácidos esenciales.

La cantidad de ADN por genoma haploide (un solo juego cromosómico), en el caso de los organismos diploides como el ser humano, el valor C es la cantidad correspondiente a un juego de 23 cromosomas.

Agente infeccioso que posee material genético en forma de ADN o ARN con una envuelta proteica y que es incapaz de llevar a cabo actividades metabólicas o reproducirse por sí solo, teniendo que invadir una célula huésped (procarionte, eucarionte vegetal, eucarionte animal) para obtener la energía para sobrevivir.

Vector de clonamiento en la forma de un cromosoma artificial de levadura. Es un vector que pretende imitar las características de un cromosoma normal de una levadura (eucariota), portando un centrómero y telómeros terminales. Esto permite clonar en levaduras, largas secuencias de ADN eucarionte (200 kb - 3.000 kb).

También llamado cremallera de leucina es un motivo supersecundario de proteínas que consta de dos segmentos peptídicos en hélice alfa. En un extremo, estas hélices interaccionan entre sí gracias a la interacción entre cadenas laterales de leucina y en el otro lo hacen con secuencias específicas de bases en el surco mayor del ADN. Es un dominio de dimerización de expresión, en particular en proteínas de la clase factores de transcripción.