EXPLICACIÓN:

Las tres fases del análisis de ligamiento son las siguientes:

1. Establecer los haplotipos de cada individuo: Se analizan los múltiples marcadores de ADN dispuestos a cada lado (marcadores flanqueantes) o dentro (marcadores intragénicos) de la región del gen de interés, con objeto de determinar el conjunto de marcadores (haplotipos) de cada miembro de la familia.

2. Establecer la fase, comparando los haplotipos entre los miembros de la familia: Mediante la comparación de los haplotipos de los miembros de la familia con un estado genético conocido (es decir, afectados, no afectados), se puede identificar el haplotipo asociado con el alelo patológico.

3. Determinar el estado genético: Una vez establecido el haplotipo asociado con la enfermedad, es posible determinar el estado genético de los miembros de una familia de riesgo.


Ejemplo: Análisis de ligamiento para el diagnóstico prenatal de una enfermedad ligada al cromosoma X.



Algunas implicaciones clínicas

El análisis de ligamiento se utiliza generalmente cuando el análisis de ADN directo no es viable, porque se desconoce el gen de interés o no se puede detectar una mutación en ese gen en una familia específica.
 

En la mayoría de los casos, el haplotipo en sí carece de significación; sólo tiene sentido en el contexto de un estudio familiar. Sólo en el caso raro de que el desequilibrio del ligamiento sea un haplotipo específico, habrá una probabilidad muy elevada de que esté asociado con una mutación patológica específica.

La exactitud del análisis de ligamiento depende de:

La exactitud del diagnóstico clínico en un miembro o miembros de la familia que estén afectados.

La distancia entre la mutación patológica y los marcadores. El análisis de ligamiento puede proporcionar resultados falso positivo o falso negativo si, durante la formación de los gametos (meiosis), se produce recombinación que implique a los marcadores y suponga un intercambio entre el material genético de los cromosomas heredados de la madre o del padre. El riesgo de recombinación es proporcional a la distancia entre la mutación patológica y los marcadores. El riesgo de recombinación es más bajo si se utilizan marcadores intragénicos.

La informatividad de los marcadores genéticos en la familia del paciente. Si la secuencia de ADN de una variante determinada difiere entre los cromosomas heredados de la madre y del padre, este marcador es informativo. Por el contrario, si la secuencia de ADN de una variante determinada no difiere entre los dos cromosomas, el marcador no es informativo.